מנהג ישראל לכסות את השופר קודם התקיעות בציבור. עם זאת, הלכה היא שבשעה שמברכים על מצווה יש להחזיק את החפץ של המצווה ביד, ולכן בשעת הברכה על בעל התוקע להחזיק את השופר מתחת לכיסוי, ורק לאחר מכן להוציא את השופר ולתקוע. לאחר התקיעות חוזרים ומכסים את השופר ומשאירים אותו מכוסה עד התקיעות הבאות.

את השופר יש לאחוז ביד ימין ולא ביד שמאל, שכן "השטן עומד על ימינו לשִׂטנו", אך אין זה מעכב. כמו כן, לדעת הרמ"א הפה של השופר צריך להיות מופנה כלפי מעלה, ולפי הסוד יש מקפידים להפך, אך גם זה אינו מעכב.