קליפות גרעינים ואגוזים וכן קליפות ביצים או גרעיני פירות שאינם ראויים לאכילה הם "מוקצה" ואסור לטלטל אותם בשבת, אך בשעת האכילה מותר להוציא אותם מהפה כדי להניח אותם בצלחת. לדעת רבים מהפוסקים אין צורך להניח אותם מיד אלא מותר להוליך אותם למקום בו רוצים להשליכם אך אין להשהותם ביד ללא צורך. לאחר שמניחים את הקליפות והגרעינים אסור לטלטלם שנית.

עצמות וקליפות שראויות למאכל בעלי חיים אם מצויים באותו מקום בעלי חיים שאוכלים אותם אינם "מוקצה" אף אם אין כל כוונה להביא אותם לבעל החיים. כמו כן עצמות, קליפות או גרעין שנשארו עליהם שאריות אוכל הראויות לאכילה אינם "מוקצה".