גם ביום טוב שחל בשבת אומרים את "ברכת מעין שבע" אלא שאין מזכירים את היום טוב בברכה זו. יוצא דופן הוא לילה ראשון של פסח שחל בשבת שאין אומרים בו "ברכת מעין שבע" מכיוון שהוא לילה המשומר מן המזיקים. הנוהגים על פי הקבלה נהגו לומר את "ברכת מעין שבע" גם בליל הסדר וכן נהג הרב מרדכי אליהו.