מצווה להתוודות ביום הכיפורים על החטאים שחטאנו במשך השנה, ולפי דעת רבנו יונה יש בווידוי של יום הכיפורים מצוות עשה מיוחדת הנלמדת מהפסוק: "לפני ה' תטהרו".

מתחילים להתוודות בתפילת הלחש של מנחה בערב יום הכיפורים, כדי להתוודות וידוי אחד עוד קודם הסעודה המפסקת. ונכון לחזור ולהתוודות פעם נוספת לפני כניסת יום הכיפורים כדי להיכנס ליום הכיפורים בקדושה ובטהרה. מנהג קהילות אשכנז לומר "תפילה זכה" שיש בה וידוי לפני כניסת היום, והספרדים אומרים וידוי בפיוט "לך א-לי תשוקתי".